Nuevamente, en 1913 se disputaron dos campeonatos de Copa, camisetas de futbol baratas antes del acuerdo definitivo que permitió la reunificación definitiva del fútbol español con la constitución de la Real Federación Española de Fútbol ese mismo año. Posteriormente vencerían al Malmö y al Benfica, para disputar la semifinal ante el Real Madrid. El partido de vuelta en el estadio Olímpico de Múnich estaba lleno, y Paul Breitner jugaría con la camiseta del Real Madrid. El primer partido fue contra Serbia. Copa de Europa», y anotaría al 57′ el único gol del partido ante el Saint-Étienne para ganar por tercera vez la Copa de Campeones de Europa. Participan los equipos de Primera (20) y los equipos no filiales de Segunda (21, todos salvo el Villareal B), los cinco primeros equipos no filiales de cada grupo de Primera RFEF (10 en total), los cinco primeros equipos no filiales de cada grupo de Segunda RFEF (25 en total), los equipos no filiales campeones de cada grupo de Tercera RFEF (18 en total) y los siete mejores segundos (sin tener en cuenta equipos filiales) de toda Tercera RFEF (7), todos ellos de la anterior temporada a la presente edición de la Copa.
Desde entonces se ha clasificado cuatro veces consecutivas para la fase de ascenso a Segunda División B, consistente en superar tres eliminatorias contra otros tantos equipos del resto de grupos de la Tercera división. Aunque ya se habían disputado encuentros contra otros equipos, no es hasta 1996 que la Federación Canaria de Fútbol formaliza la creación de una selección autonómica, que reúne a los mejores jugadores canarios y disputa partidos oficiales contra otras selecciones autonómicas. Una temporada más tarde el Bayern conquistó su cuarto doblete, dirigiendo la liga por un margen estrecho. Para la temporada de 2007-08, el Bayern hizo cambios drásticos de la escuadra para ayudar a reforjar y reconstruir al equipo. Beckenbauer regresó brevemente al final de la temporada de 1995-96 como entrenador adjunto y condujo al equipo hacia la victoria en la Copa de la UEFA 1995-96, venciendo al Girondins de Burdeos en la final. Finalmente el violeta ganó el título en la última fecha, al vencer a Juventud de visitante por 2-1. Junto a este torneo, y a la buena participación de Defensor Sporting en el Torneo Apertura, en la que quedó tercero con 30 puntos, le valió para volver a ganar la Tabla Anual por segunda temporada consecutiva, accediendo a la definición por el título con ventaja deportiva.
En Marsella 2008, la primera participación en una copa mundial, los salvadoreños perdieron sus tres encuentros de la primera fase ante Portugal (2:8), Italia (1:4) -que terminaron en segundo y tercer puesto del torneo, respectivamente-, e Islas Salomón (3:6). Los mejores anotadores fueron Agustín Ruiz y Tomás Hernández, cada uno con dos goles. El grupo acabó siendo el más igualado de la primera fase, y los cuatro equipos finalizaron empatados a 4 puntos, con el mismo número de victorias, empates y derrotas, por lo que hubo de decidir el orden para ver qué tres selecciones accedían a los octavos de final mediante el «goal-average». 1969-70 Primera ronda C.D. Después de un segundo lugar en 1990-91, el club solo obtuvo cinco puntos más que los clubes descendidos en 1991-92. En la temporada de 1992-93, el Bayern perdió en la Copa de la UEFA en la segunda ronda contra el Norwich City -único club inglés que le ha derrotado en su antiguo estadio, el estadio Olímpico de Múnich-. En la temporada de 2010-11 fueron eliminados en la ronda de octavos en la Liga de Campeones de la UEFA 2010-11 nuevamente por el Inter de Milán por la citada regla de goles fuera de casa.
El éxito regresó cuando Franz Beckenbauer asumió el control en la segunda mitad de la temporada de 1993-94, ganando la Bundesliga nuevamente después de una brecha de cuatro años. La temporada de 2001-02 comenzó con una victoria en la Copa Intercontinental ante Boca Juniors de Argentina, pero acabó sin otro trofeo. El anterior entrenador Jupp Heynckes volvió a ser nombrado de forma interina hasta el fin de la temporada. En 1979 asumió Uli Hoeneß el cargo de entrenador a la edad de 27 años y relevó así al consejero de Beckenbauer, Robert Schwan. Pál Csernai sustituyó al entrenador Gyula Lorant, mientras que el presidente Neudecker se marchó porque el equipo había rechazado al antiguo «león» Max Merkel como entrenador. Sería a finales del mismo año 2003 cuando José Ángel Biel, Vicepresidente del Gobierno de Aragón, como parte del largo proceso que aún debía superarse, remitió formalmente al entonces Ministerio de Ciencia y Tecnología la solicitud de un canal de televisión a nivel regional para su explotación tanto en analógico como en digital. Usualmente estas páginas acomodan la información de los momios o cuotas adentro de tablas interactivas en las que los jugadores pueden saber cuánto dinero pueden llegar a ganar incluso antes de colocar las apuestas.